花土沟海拔约2689至3800米。青海省海西蒙古族藏族自治州茫崖市下辖的花土沟镇位于茫崖市东部。阿尔金山地势西北高，东南低，北部耸立着阿尔金山，西南部耸立着白雪皑皑的阿卡其曼塔格山，形成了山盆相间的地形格局。除北部的阿合提山和西南部的阿卡其曼塔格山外，占全镇总面积约80%的盆地地区海拔在2689至3800米之间。
花土沟是位于青海省西北部的一个城镇。花土沟镇有大小湖泊10多个，其中嘎斯湖和茫崖湖是较大的咸水湖，发源于西南山前的咸海，成为该镇生活用水的来源之一。
花土沟镇属中国大陆沙漠气候类型，少雨或无雨，空气干燥，日温差大，夏季日照充足，易发生霜冻、干旱、沙尘暴和大雪等自然灾害。
花土沟镇有镁、铁、金、银泛滥等20多种矿产资源，其中天青石、石油、天然气、芒硝储量丰富。花土沟镇有甘草、麻黄、雪莲、枸杞、雪莲等野生植物资源250余种。花土沟镇有国家一级保护动物野骆驼、野马、雪豹、棕熊、猞猁、藏雪鸡等110多种野生动物。
